浮游植物衍生的有机硫酸盐越来越被认可为海洋碳与硫循环之间的重要纽带，但这些化合物的间歇性输入是否能在自然高生产力系统中构建微生物群落仍不明确。我们通过结合磺基喹镌唑二酰甘油（SQDG）及其降解产物的靶向测量、微生物群落测序、生态组装分析和宏转录组剖析，研究了南中国海北部琼东上升流系统中的这一问题。在一次显著的夏季上升流事件中，SQDG、磺基喹糖（SQ）、磺基喹镉基甘油（SQGro）和2,3-二羟丙烷-1-磺酸盐（DHPS）的浓度在晚期上升期显著上升，峰值浓度比早期阶段高出多达两个数量级。这些有机硫化合物在高光区富集，合计贡献了3.9%±2.2%的有机颗粒碳和1.7%±1.5%的有机颗粒硫，其中SQDG为主导成分。冗余分析显示，上升流区的有机硫磺酸分布主要与荧光和异养细菌丰度相关，而非上升流水域则以养分条件为主。细菌群落从早期以寡营养性SAR11为主导阶段转变为富含共养性罗紫杆菌科和鞘菌科的晚期阶段，但大部分群落变异主要由温度和颗粒有机碳而非有机硫磺酸盐解释。宏转录组进一步揭示了生活方式特异性的反应：颗粒相关群落保持相对稳定，而自由生活的细菌则在碳、氮、磷和硫代谢途径的晚期阶段表现出广泛的活化。与有机磺酸相关的转录本与DMSP/DMS降解转录本相当，但低于碳水化合物和氨基酸降解转录本。这些发现表明，沿海上升流产生强烈的生物耦合有机硫磺酸脉冲，但这些化合物主要作为更广泛藻华来源资源网络中的专门底物，而非细菌群落组成的主导过滤器。